Tiba-tiba, mereka datang: alien parasit yang turun ke Bumi dan dengan cepat menyusup ke dalam umat manusia dengan menggali ke dalam otak target yang rentan. Makhluk-makhluk yang tak pernah puas ini memperoleh kendali penuh atas inangnya dan mampu bermorfosis menjadi berbagai bentuk untuk memangsa mangsa yang tidak curiga.
Shinichi Izumi, seorang siswa SMA berusia enam belas tahun, menjadi korban salah satu parasit ini, tetapi parasit tersebut gagal menguasai otaknya, malah berakhir di tangan kanannya. Karena tidak dapat berpindah tempat, parasit tersebut, yang sekarang bernama Migi, tidak punya pilihan selain bergantung pada Shinichi untuk tetap hidup. Dengan demikian, keduanya terpaksa hidup berdampingan dalam keadaan yang tidak nyaman dan harus membela diri dari parasit-parasit bermusuhan yang berharap untuk membasmi ancaman baru ini bagi spesies mereka.
