Chiyo Sakura adalah seorang siswi SMA yang ceria dan jatuh cinta mati-matian pada Umetarou Nozaki yang tidak menyadari perasaannya. Yang membuat Chiyo bingung, ketika ia menyatakan perasaannya kepada Nozaki, Nozaki memberinya tanda tangan yang tidak dikenalnya. Ternyata, remaja yang pendiam itu sebenarnya adalah seorang seniman manga shoujo yang dihormati, yang menerbitkan karyanya dengan nama pena Sakiko Yumeno! Serangkaian kesalahpahaman menyebabkan Chiyo menjadi salah satu asisten manga Nozaki.
Sepanjang peristiwa lucu yang terjadi, ia berteman dengan banyak teman sekolahnya yang unik, termasuk asistennya yang tampaknya tidak tahu malu, Mikoto Mikoshiba, dan “Pangeran Sekolah,” Yuu Kashima. Gekkan Shoujo Nozaki-kun mengikuti Chiyo saat ia berusaha membantu Nozaki dengan manganya dan berharap Nozaki akhirnya akan menyadari perasaannya.
