Kelas 3-Z SMA Gintama—yang dipimpin oleh guru Ginpachi Sakata—terkenal dengan murid-muridnya yang eksentrik dan kesulitan dalam belajar. Terlebih lagi, Ginpachi dan murid-muridnya sering berurusan dengan kepala sekolah yang menuntut dan para siswa nakal yang ditakuti di kelas tersebut, yang telah kembali dari skorsing.
Terlepas dari semua kekacauan dan sikap acuh tak acuh Ginpachi terhadap pengajaran, murid-muridnya tetap sangat menghormatinya. Meskipun terus-menerus terganggu dari pelajaran mereka, Ginpachi dan kelasnya yang kocak selalu menemukan cara untuk membuat hari-hari sekolah mereka tetap menyenangkan.
