Selama tiga tahun terakhir, SMP Teikou telah mendominasi kancah bola basket nasional dengan susunan pemain legendarisnya: “Generasi Keajaiban.” Tim ini terdiri dari lima pemain berbakat yang unggul dalam olahraga ini, tetapi “Pemain Keenam Misterius” mengintai di balik bayangan dan membantu tim tersebut meraih status yang dihormati. Akhirnya, pertumbuhan mereka yang luar biasa membuat mereka jenuh dengan olahraga yang mereka cintai dan membuat mereka berpisah di sekolah menengah atas.
Dalam mencari anggota baru, tim bola basket SMA Seirin merekrut Taiga Kagami dan Tetsuya Kuroko, dua siswa baru yang tampaknya memiliki perbedaan kemampuan yang signifikan. Kagami, yang baru saja kembali dari Amerika, memiliki bakat alami dan kecintaan yang tak henti-hentinya pada olahraga ini. Sementara itu, Kuroko kurang memiliki karisma dan tidak menunjukkan bakat atletik yang luar biasa. Namun, kemudian terungkap bahwa dia adalah Pemain Keenam Misterius Teikou—pemain yang pernah menjadi bagian dari Generasi Keajaiban.
Kuroko ingin membuktikan kepada tim Seirin bahwa dia kuat dengan caranya sendiri. Melihat keyakinannya, Kagami membentuk kemitraan dinamis dengan Kuroko, yang terakhir berjanji untuk mendukung “cahaya” Kagami sebagai “bayangannya”. Bersama rekan satu tim Seirin yang baru, mereka bertujuan untuk menaklukkan kejuaraan Interhigh yang akan datang, tetapi kemunculan kembali mantan rekan satu tim Kuroko mempersulit rencana mereka.
